近日，浦京集团谭宁华/陈凌云团队在Nature Communications发表了题为“Phylotranscriptomics reveals the phylogeny of Asparagales and the evolution of allium flavor biosynthesis” 的研究论文。中国科学院武汉植物园王青锋研究员、浦京集团谭宁华教授、广西壮族自治区药用植物园韦坤华研究员 (现广东药科大学教授)、浦京集团陈凌云副教授为共同通讯作者，350vip浦京集团为第一通讯单位。浦京集团2024届硕士生王肖肖、复旦大学黄建勋副研究员、慕尼黑大学Diego F. Morales-Briones为并列第一作者，350vip浦京集团为第一单位。
天门冬目是单子叶植物纲最大的目，包括天门冬科、石蒜科、兰科等14个科，以及许多具有重要药用、生态、经济价值的植物，如石斛、大蒜、石刁柏等。葱属硫化物（CSOs）是天门冬目石蒜科葱属植物含有的一类特殊化合物，它们赋予大蒜、薤白等植物特殊的风味，也是许多中药品种的活性成分，具有显著的抗菌、抗炎等药理活性。
尽管大量学者研究了天门冬目的系统演化以及CSOs的生物合成，但天门冬目存在的系统演化冲突的内在机制仍然不清楚。CSOs的起源、影响其多样化的遗传机制也不明晰。该研究利用大量转录组和基因组数据，采用最新的、复杂的分析技术，构建了天门冬目的系统演化树，并探讨了天门冬目多样的网状进化关系，及其形成原因。结合系统演化树，该研究发现基因拷贝数扩增、表达量上调、氨基酸突变共同促进了CSOs的生物合成和多样性。这些结果对于理解天门冬目植物的起源、CSOs的生态功能，开展相关药用植物的保护工作，开发CSOs的药用价值具有重要意义。
该研究得到了国家自然科学基金委、广西创新驱动发展专项、中国科学院中非联合研究中心等机构的项目资助。
文章链接：https://www.nature.com/articles/s41467-024-53943-6
葱属硫化物生物合成相关基因的拷贝数和表达水平
（供稿单位：中药学院，撰写人：王湘雨，审稿人：刘帆）